Stony Brook Üniversitesi (SUNY – State University of New York System), Amerika Birleşik Devletleri’nin New York eyaletindeki Suffolk idari bölgesinin Brookhaven kentindeki Stony Brook sayım yerleşiminde bulunan, araştırma odaklı bir devlet üniversitesidir. 1957 yılında ortaokul matematik ve fen bilimleri öğretmenlerinin yetiştirilmesi amacıyla bir kolej olarak kurulmuş olup, kurulduğu günden bu yana eğitimini verdiği akademik programların sayısını artırarak, büyük bir araştırma ve eğitim kurumu hâline gelmiştir. Stony Brook Üniversitesi, New York Eyalet Üniversitesi Sistemi’nin bir parçası olup, 25.000’den fazla öğrencisi ve 2.600’den fazla öğretim üyesi ile Long Island’daki en büyük yükseköğretim kurumlarından biridir. Üniversite; mühendislik, işletme, eğitim bilimleri, sağlık bilimleri, sosyal bilimler, beşeri bilimler ve güzel sanatlar gibi alanlarda 200’den fazla lisans ve yüksek lisans derece programı sunmaktadır. Stony Brook Üniversitesi, özellikle tıp, bilgisayar bilimleri ve mühendislik alanlarındaki araştırma programları ile bilinmektedir. Üniversite; Stony Brook University Cancer Center, Institute for Advanced Computational Science ve Center for Communicating Science da dahil olmak üzere çok sayıda araştırma merkezi ve enstitülere ev sahipliği yapmaktadır.
