Üniversitenin birden fazla spor kulübü bulunmaktadır. Öğrenciler kulüpler sayesinde diğer insanlarla sosyalleşebilir ve ilgileri doğrultusunda kendilerini geliştirebilirler. Bowdoin College, aşağıdaki spor kulüplerine sahiptir:
- Kayak
- Voleybol
- Tenis
- Su topu
- Rugby
- Binicilik
- Kürek
- Frizbi
- Futbol